Podnikatelé se stali první skupinou potenciálních příjemců pomoci ze strukturálních fondů Evropské unie v ČR, kteří již od března 2007 mohou předkládat své žádosti o podporu již v rámci nového programovacího období 2007 — 2013. MPO už v únoru 2007 vyhlásilo programy podpory z OPPI — Marketing a Rozvoj, u kterých do současnosti zaznamenalo více jak 100 registračních žádostí malých a středních podnikatelů a přes 400 žádostí o založení tzv. Master účtu v elektronickém systému eAccount. Tím se podnikatelům otevřel prostor pro zahájení předkládáni projektů, které po schválení Operačního programu Podnikání a inovace Evropskou komisí budou financovány z Evropského fondu pro regionální rozvoj.
V minulých týdnech byla zahájena oficiální jednání České republiky o obsahu Národního strategického referenčního rámce, jenž tvoří základní rámec pro vyjednávání jednotlivých operačních programů v ČR. Bez dosažení shody s Evropskou komisí a schválení tohoto strategického dokumentu pro Českou republiku nemohou být uzavřena jednání o navržených prioritních osách Operačního programu Podnikání a inovace. Současný postoj Evropské komise však skýtá naději, že by se tak mohlo stát do června 2007. S tím souvisí postup při vyhodnocování předložených projektů v rámci již vyhlášených programů OPPI a proces jejich schvalování. První rozhodnutí o poskytnutí dotace totiž budou moci být vydávána až po schválení OPPI orgány Evropské komise.
Vláda České republiky schválila v lednu 2007 celkem 15 programů podpory v rámci programu, které jsou zaměřeny jak na přímou podporu firem (zejména malých a středních), tak na další budování a zkvalitňování infrastruktury pro podnikání. Cílem ministerstva průmyslu a obchodu je nyní vyjednat rychlé schválení operačního programu a postupně zahájit příjem žádostí i do zbývajících programů podpory v rámci programu, jako Školící střediska, ICT a strategické služby, Poradenství aj. Vyhlášení některých z nich, jako např. Prosperita, Spolupráce a Nemovitosti je však vázáno na složité vyjednání i specifických podmínek pro poskytování veřejné podpory.
Postupný náběh implementace programu ve vazbě na momentální možnosti a uvážlivě zhodnocená rizika ministerstva průmyslu a obchodu spojená s vyhlášením nových programů před schválením celého operačního programu Evropskou komisí však umožní podnikatelům připravit si s dostatečným předstihem své projekty a ve vztahu k již vyhlášeným programům podpory tyto event. i realizovat s tím, že výdaje uskutečněné před schválením projektu ale po registraci žádosti o podporu budou moci být v případě následného kladného rozhodnutí o žádosti započteny zpětně do uznatelných výdajů, čímž se rovněž podstatně zkrátí doba pro reálné získání peněz ze strukturálních fondů EU, resp. pro jejich převod na účty takto úspěšných podnikatelů.

